大量元素水溶肥的施用方法十分简便，它可以随着灌溉水包括喷灌、滴灌等方式进行灌溉时施肥，既节约了水，又节约了肥料，而且还节约了劳动力，这在劳动力成本日益高涨的今天使用水溶性肥料的效益是显而易见的。
由于水溶性肥料的施用方法是随水灌溉，所以使得施肥极为均匀，这也为提高产量和品质奠定了坚实的基础。水溶性肥料一般杂质较少，电导率低，使用浓度十分方便调节，所以它即使对幼嫩的幼苗也是的，不用担心引起烧苗等不良后果。
施用时应注意以下两大要点：
1.避免直接冲施
不要按照冲施复合肥的做法直接冲施，而要采取“二次稀释”冲肥法。
目前，有的农户直接按照冲施一般复合肥的做法冲施水溶肥，结果造成了冲肥不均匀，冲肥量多的蔬菜出现伤根、黄叶情况，冲肥量少的蔬菜则长势受影响。二次稀释不仅利于肥料施用均匀，还可以提高肥料利用率。水溶肥比一般复合肥养分含量高，用量少，一般亩用8—10公斤即可。
2.穴施
穴施水溶肥要注意施用量。
穴施肥料具有用肥集中、利用率高、用肥少等特点，目前，不少农户对穴施水溶肥的用量把握不准，结果出现了烧根、烧苗的情况。因此，穴施水溶肥一定要注意施用量，而且要与土搅拌均匀后再栽苗。
3.喷施
水溶肥喷施时，尽量单用，或者与非碱性的农药混用。
在蔬菜作物出现缺素症或根系生长不良时，不少农户多选用水溶肥来喷施加以缓解。建议农户尽量单独喷施水溶肥，或者与非碱性的农药混用，以免金属离子起反应产生沉淀，造成叶片肥害或药害。
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